Vírus RNA de cadeia dupla

ReoviridaeEdit

Reoviridae estão actualmente classificados em nove géneros. Os genomas destes vírus consistem em 10 a 12 segmentos de dsRNA, cada um geralmente codificando uma proteína. Os viriões maduros são não-envelopesados. Seus capsids, formados por múltiplas proteínas, têm simetria icosaédrica e estão dispostos geralmente em camadas concêntricas. Uma característica distintiva dos vírus dsRNA, independentemente da sua associação familiar, é a sua capacidade de realizar a transcrição dos segmentos de dsRNA, sob condições apropriadas, dentro do capsid. Em todos estes vírus, as enzimas necessárias para a transcrição endógena fazem assim parte da estrutura virional.

OrthoreovirusesEdit

Os orthoreoviruses (reovírus) são os membros prototípicos da família dos vírus Reoviridae e representativos dos membros tartarugas, que compreendem cerca de metade dos gêneros. Como os outros membros da família, os reovírus são não-envelopes e caracterizados por conchas concêntricas que encapsulam um genoma dsRNA segmentado. Em particular, os reovírus têm oito proteínas estruturais e dez segmentos de dsRNA. Uma série de etapas não revestidas e alterações conformacionais acompanham a entrada e replicação celular. As estruturas de alta resolução são conhecidas por quase todas as proteínas do reovírus de mamíferos (MRV), que é o genótipo mais bem estudado. A crio-microscopia eletrônica (cryoEM) e a cristalografia de raios X forneceram uma riqueza de informações estruturais sobre duas cepas específicas de MRV, tipo 1 Lang (T1L) e tipo 3 Dearing (T3D).

CypovirusEdit

Os vírus da poliedrose citoplasmática (CPV) formam o gênero Cypovirus da família Reoviridae. Os CPVs são classificados em 14 espécies com base nos perfis de migração eletroforética de seus segmentos genômicos. O cipovírus tem apenas uma única concha de capsidro, que é semelhante ao núcleo interno do ortovírus. O CPV apresenta uma estabilidade capsidar impressionante e é totalmente capaz de transcrição e processamento endógeno de RNA. As dobras gerais das proteínas do CPV são semelhantes às de outros reovírus. No entanto, as proteínas CPV têm domínios de inserção e estruturas únicas que contribuem para as suas extensas interacções intermoleculares. A proteína da torre de CPV contém dois domínios de metilase com um par de hélices altamente conservado/β-sheet/helix-pair sandwich fold mas falta a dobra de barril β presente no orthoreovirus λ2. O empilhamento dos domínios funcionais da proteína da torreta e a presença de constrições e picos A ao longo da via de liberação do mRNA indicam um mecanismo que usa poros e canais para regular as etapas altamente coordenadas de transcrição, processamento e liberação do RNA.

RotavirusEdit

Rotavirus é a causa mais comum de gastroenterite aguda em bebês e crianças pequenas em todo o mundo. Este vírus contém um genoma de dsRNA e é um membro da família Reoviridae. O genoma do rotavírus é constituído por onze segmentos de dsRNA. Cada segmento do genoma codifica uma proteína, com exceção do segmento 11, que codifica duas proteínas. Entre as doze proteínas, seis são estruturais e seis são não-estruturais. É um vírus de dupla cadeia de RNA não-envelopado

Vírus da língua azulEdit

Os membros do gênero Orbivirus dentro da família Reoviridae são vírus derivados de artrópodes e são responsáveis por alta morbidade e mortalidade em ruminantes. O vírus da febre catarral ovina (BTV) que causa doenças no gado (ovinos, caprinos, bovinos) tem estado na vanguarda dos estudos moleculares nas últimas três décadas e agora representa o orbivírus mais bem compreendido a nível molecular e estrutural. O BTV, como outros membros da família, é um vírus complexo não-envelopado com sete proteínas estruturais e um genoma de RNA que consiste em 10 segmentos de dsRNA de tamanhos variados.

PhytoreovirusesEdit

Phytoreoviruses são reovírus não ressuscitados que são os principais patógenos agrícolas, particularmente na Ásia. Um membro desta família, Rice Dwarf Virus (RDV), tem sido amplamente estudado por criomicroscopia eletrônica e cristalografia por raios X. A partir destas análises, foram derivados modelos atómicos das proteínas do capsid e um modelo plausível para a montagem do capsid. Enquanto as proteínas estruturais do RDV não partilham uma sequência semelhante a outras proteínas, as suas dobras e a estrutura geral da cápside são semelhantes às de outros Reoviridae.

Saccharomyces cerevisiae virus L-AEdit

O vírus L-A dsRNA da levedura Saccharomyces cerevisiae tem um único segmento genómico de 4,6 kb que codifica a sua principal proteína de revestimento, Gag (76 kDa) e uma proteína de fusão Gag-Pol (180 kDa) formada por um ribosomal -1 frameshift. L-A pode suportar a replicação e encapsulação em partículas virais separadas de qualquer um dos vários dsRNAs de satélite, chamados M dsRNAs, cada um dos quais codifica uma toxina proteica secretada (a toxina assassina) e imunidade a essa toxina. L-A e M são transmitidos de célula para célula pela mistura citoplasmática que ocorre no processo de acasalamento. Nenhuma delas é libertada naturalmente da célula ou entra nas células por outros mecanismos, mas a alta frequência do acasalamento de leveduras na natureza resulta na ampla distribuição destes vírus em isolados naturais. Além disso, as semelhanças estruturais e funcionais com os vírus dsRNA dos mamíferos tem tornado útil considerar estas entidades como vírus.

Vírus da doença bursal infecciosaEdit

Vírus da doença bursal infecciosa (IBDV) é o membro mais bem caracterizado da família Birnaviridae. Estes vírus têm genomas dsRNA bipartidos encerrados em capilares icosaédricos de camada única com geometria T = 13l. O IBDV compartilha estratégias funcionais e características estruturais com muitos outros vírus dsRNA icosaédricos, exceto que lhe falta o núcleo T = 1 (ou pseudo T = 2) comum aos Reoviridae, Cystoviridae, e Totiviridae. A proteína capsidar IBDV exibe domínios estruturais que mostram a homologia das proteínas capsidar de alguns vírus RNA de um só sentido positivo, como os nodavírus e tetravírus, bem como a proteína T = 13 da casca do capsidar dos Reoviridae. A concha T = 13 da cápsula do IBDV é formada por trimers de VP2, uma proteína gerada pela remoção do domínio terminal C do seu precursor, pVP2. O corte do pVP2 é realizado em partículas imaturas como parte do processo de maturação. A outra proteína estrutural principal, VP3, é um componente multifuncional deitado sob a casca T = 13 que influencia o polimorfismo estrutural inerente ao pVP2. A RNA polimerase dependente de RNA codificada com vírus, VP1, é incorporada ao capsid através da sua associação com VP3. VP3 também interage extensivamente com o genoma dsRNA viral.

Bacteriófago Φ6Edit

Bacteriófago Φ6, é um membro da família Cystoviridae. Infecta a bactéria Pseudomonas (tipicamente P. syringae fitopatogênica). Tem um genoma de RNA segmentado em três partes, de dupla cadeia, totalizando ~13,5 kb de comprimento. Φ6 e seus parentes possuem uma membrana lipídica ao redor de sua nucleocápside, um traço raro entre os bacteriófagos. É um fago lítico, embora sob certas circunstâncias tenha sido observado um atraso na lise que pode ser descrito como um “estado portador”.