Microflora of the gastrointestinal tract: a review

Mukosalytan i människans mag-tarmkanal är cirka 200-300 m2 och koloniseras av 1013-14 bakterier av 400 olika arter och underarter. Savage har definierat och kategoriserat den gastrointestinala mikrofloran i två typer, den autochtona floran (inhemsk flora) och den allochtona floran (övergående flora). Autochtona mikroorganismer koloniserar särskilda livsmiljöer, dvs. fysiska utrymmen i mag-tarmkanalen, medan alloktona mikroorganismer inte kan kolonisera särskilda livsmiljöer utom under onormala förhållanden. De flesta patogener är alloktona mikroorganismer, men vissa patogener kan vara autochtona i ekosystemet och lever normalt i harmoni med värden, utom när systemet störs. Prevalensen av bakterier i olika delar av mag-tarmkanalen verkar vara beroende av flera faktorer, t.ex. pH, peristaltik, redoxpotential, bakterieadhesion, bakteriellt samarbete, mucinutsöndring, näringstillgång, kost och bakteriell antagonism. På grund av det låga pH-värdet i magsäcken och den relativt snabba peristaltiken genom magsäcken och tunntarmen innehåller magsäcken och de övre två tredjedelarna av tunntarmen (duodenum och jejunum) endast ett lågt antal mikroorganismer, som ligger på 103-104 bakterier/mL av magsäcks- eller tarminnehållet, huvudsakligen syretoleranta laktobaciller och streptokocker. I den distala tunntarmen (ileum) börjar mikrofloran likna den i tjocktarmen, med cirka 107-108 bakterier/mL av tarminnehållet. Med minskad peristaltik, surhet och lägre oxidations-reduktionspotential upprätthåller ileum en mer diversifierad mikroflora och en högre bakteriepopulation. Troligen på grund av den långsamma tarmmotiliteten och den mycket låga oxidations-reduktionspotentialen är tjocktarmen den primära platsen för mikrobiell kolonisation hos människor. Tjocktarmen hyser ett enormt antal och arter av bakterier. 99,9 % av kolonens mikroflora är dock obligatoriskt anaeroba bakterier.