Human Protein Atlas
On oktober 19, 2021 by adminSökfunktionen kan användas för fritextsökning (skriv vad som helst i sökfältet) eller för mer komplexa sökningar med hjälp av ”fält” (se exempel).
Fri textsökningen söker efter fullständiga och partiella träffar på gennamn, gensynonymer, genbeskrivningar, externa (UniProt, Ensembl, NCBI Entrez Gene) gen- och proteinidentifierare, proteinklasser, Gene Ontology-identifierare och -beskrivningar, antikroppsidentifierare och bildannotationer. Fritextfrågan måste vara minst tre tecken lång.
Specifika fält kan sökas med hjälp av ”Fields”-funktionen. Tillgängliga fält är följande: Gennamn (HGNC-namn eller synonymer), proteinklass, kromosom, extern identifierare (Ensembl-gen-, transkript- eller proteinidentifierare, UniProt-anslutningsnummer, NCBI Entrez-genidentifierare), subcellulär lokalisering baserad på immunofluorescensfärgning i tre olika cellinjer, organ-, vävnads-, uttryck i vävnad, cancer och cellinje, valideringsresultat för antikroppar i fyra olika tester (IH=immunohistokemi, IF=immunofluorescens, WB=Western blot, PA=Protein array), evidenspoäng och en filtrering av gener med enbart antikroppar och gener med kunskapsbaserat annoterat proteinuttryck (IH, IF).
Lämna ett svar