Diagnostiskt test för Angelman och Prader-Willi är snabbt, exakt och billigare
On januari 5, 2022 by adminForskare har utvecklat ett nytt snabbt och exakt molekylärt diagnostiskt test för patienter med antingen Angelman- eller Prader-Willi-syndrom.
Din studie, ”A rapid and accurate methylation-sensitive high-resolution melting analysis assay for the diagnosis of Prader Willi and Angelman patients”, publicerades i Molecular Genetics & Genomic Medicine.
Prader-Willi (PWS) och Angelman (AS) syndrom är två sällsynta genetiska störningar som orsakas av imprintingdefekter i samma region av kromosom 15. Medan PWS är förknippat med funktionsförlust hos faderns gener orsakas Angelman av funktionsförlust hos moderns gener. Genomisk prägling är den process genom vilken en kopia av en gen, antingen den moderliga eller faderliga kopian, tystas genom en kemisk DNA-modifiering som kallas metylering.
”Laboratoriediagnosen av PWS och AS är en utmaning och kräver flera molekylära och cytogenetiska metoder för att belysa den genetiska mekanism som leder till utvecklingen av syndromet”, skriver forskarna.
Analyser av DNA-metyleringsmönster i en specifik region på kromosom 15 – känd som SNURF-SNRPN-lokuset genom metyleringsspecifik polymeraskedjereaktion (MS-PCR, en teknik som upptäcker förändringar i DNA-metylering i specifika regioner av en DNA-sekvens) – gör det möjligt för forskarna att diagnostisera och särskilja patienter med PWS från patienter med AS.
”Även om DNA-sekvensering anses vara ”guldstandarden” för mutationsscreening förblir denna metod relativt dyr, arbetskrävande och tidskrävande”, skriver forskarna.
I den här studien utvecklade forskarna en metod som bygger på högupplöst smältning (HRM, en teknik som gör det möjligt för forskarna att skilja mellan normala och muterade DNA-sekvenser baserat på deras smältningsprofil). Det är ett enkelt, snabbt, känsligt, specifikt och billigt alternativ till DNA-sekvensering för att diagnostisera och särskilja PWS- och AS-patienter.
För att testa och validera den nya MS-HRM-metoden isolerade forskarna först DNA från blodprov från 43 patienter som misstänktes ha antingen PWS eller AS. Därefter utförde de och jämförde resultaten från standard MS-PCR med den nya MS-HRM-metoden.
Testresultaten visade att MS-HRM och MS-PCR överensstämde i alla fall och identifierade 19 (44 %) patienter med PWS, tre (7 %) med AS och 21 (49 %) utan förändringar.
Sekvenserande fluorescens in situ-hybridisering (FISH, en teknik som gör det möjligt för forskare att visualisera specifika regioner av kromosomer märkta med en fluorescerande sond) som utfördes på 19 (44 %) patienter upptäckte fyra fall av PWS som orsakades av en deletion (där en del av DNA-sekvensen av en gen går förlorad) i kromosom 15.
MS-HRM ”behöver inte ytterligare tekniker som agarosgelelektrofores , vilket minskar tiden för att få ett korrekt resultat och minskar riskerna för korskontaminering mellan proverna”, skriver forskarna.
”Känsligheten hos MS-HRM gör det möjligt att detektera en liten bråkdel av provet är viktigt i analysen av prover, som är svåra att få fram, särskilt från nyfödda hypotona spädbarn. Dessutom gör den höga reproducerbarheten hos HRM denna metod lämplig för både forskning och diagnostiska tillämpningar i studiet av PWS- och AS-syndrom”, tillade de.
”En snabb och korrekt diagnos av PWS eller AS gör det möjligt att effektivt ingripa med läkemedel, undvika flera av dessa sjukdomars egenskaper, vilket ger en bättre livskvalitet”, avslutade de.
- Författardetaljer
.
Lämna ett svar