Virusuri cu ARN bicatenar

ReoviridaeEdit

Reoviridae sunt clasificate în prezent în nouă genuri. Genomurile acestor virusuri constau din 10 până la 12 segmente de ARNdb, fiecare dintre ele codificând în general o proteină. Virionii maturi nu sunt înveliți. Capsidele lor, formate din mai multe proteine, au simetrie icosaedrică și sunt dispuse, în general, în straturi concentrice. O trăsătură distinctivă a virusurilor cu ARNdS, indiferent de asocierea lor familială, este capacitatea lor de a efectua transcrierea segmentelor de ARNdS, în condiții adecvate, în interiorul capsidei. La toate aceste virusuri, enzimele necesare pentru transcrierea endogenă fac astfel parte din structura virionului.

OrtoreovirusuriEdit

Ortoreovirusurile (reovirusuri) sunt membrii prototipici ai familiei de virusuri Reoviridae și sunt reprezentative pentru membrii turmentați, care cuprind aproximativ jumătate din genuri. La fel ca și alți membri ai familiei, reovirusurile nu sunt învelite și se caracterizează prin învelișuri capsidale concentrice care încapsidează un genom dsRNA segmentat. În special, reovirusurile au opt proteine structurale și zece segmente de ARNdS. O serie de etape de dezacoperire și modificări conformaționale însoțesc intrarea în celulă și replicarea. Se cunosc structuri de înaltă rezoluție pentru aproape toate proteinele reovirusului mamiferelor (MRV), care este genotipul cel mai bine studiat. Crio-microscopia electronică (cryoEM) și cristalografia cu raze X au furnizat o multitudine de informații structurale despre două tulpini specifice de MRV, tipul 1 Lang (T1L) și tipul 3 Dearing (T3D).

CypovirusEdit

Virusurile poliedrozei citoplasmatice (CPV) formează genul Cypovirus din familia Reoviridae. CPVs sunt clasificate în 14 specii pe baza profilurilor de migrare electroforetică a segmentelor genomului lor. Cypovirusurile au un singur înveliș de capsidă, care este similar cu nucleul intern al ortovirusurilor. CPV prezintă o stabilitate surprinzătoare a capsidei și este pe deplin capabil să transcrie și să proceseze ARN endogen. Rândurile generale ale proteinelor CPV sunt similare cu cele ale altor reovirusuri. Cu toate acestea, proteinele CPV au domenii de inserție și structuri unice care contribuie la interacțiunile lor intermoleculare extinse. Proteina CPV turret conține două domenii de metilază cu un pliu sandwich foarte conservat de tip helix-pereche/β-sheet/helix-pereche, dar îi lipsește clapeta β-barrel prezentă în orthoreovirusul λ2. Stivuirea domeniilor funcționale ale proteinei turret și prezența constricțiilor și a vârfurilor A de-a lungul căii de eliberare a ARNm indică un mecanism care utilizează pori și canale pentru a regla etapele foarte bine coordonate de transcriere, procesare și eliberare a ARN.

RotavirusEdit

Rotavirusul este cea mai frecventă cauză de gastroenterită acută la sugari și copii mici în întreaga lume. Acest virus conține un genom dsARN și este membru al familiei Reoviridae. Genomul rotavirusului este format din unsprezece segmente de ARNdS. Fiecare segment de genom codifică pentru o proteină, cu excepția segmentului 11, care codifică pentru două proteine. Dintre cele douăsprezece proteine, șase sunt proteine structurale și șase sunt proteine nestructurale. este un virus non-învelit cu ARN dublu catenar

Virusul bolii limbii albastreEdit

Membrii genului Orbivirus din cadrul familiei Reoviridae sunt virusuri purtate de artropode și sunt responsabili de morbiditate și mortalitate ridicată la rumegătoare. Virusul bolii limbii albastre (BTV), care provoacă boli la animale de fermă (ovine, caprine, bovine), a fost în prim-planul studiilor moleculare în ultimele trei decenii și reprezintă în prezent cel mai bine înțeles orbivirus la nivel molecular și structural. BTV, la fel ca și alți membri ai familiei, este un virus complex non-învelit, cu șapte proteine structurale și un genom ARN format din 10 segmente dsRNA de diferite dimensiuni.

FitovirusuriEdit

Fitovirusurile sunt reovirusuri neturnate care sunt agenți patogeni agricoli majori, în special în Asia. Un membru al acestei familii, Rice Dwarf Virus (RDV), a fost studiat pe larg prin criomicroscopie electronică și cristalografie cu raze x. Din aceste analize, au fost derivate modele atomice ale proteinelor capsidei și un model plauzibil pentru asamblarea capsidei. În timp ce proteinele structurale ale RDV nu prezintă similitudini de secvență cu alte proteine, pliurile lor și structura globală a capsidei sunt similare cu cele ale altor Reoviridae.

Saccharomyces cerevisiae virus L-AEdit

Virusul L-A dsRNA al drojdiei Saccharomyces cerevisiae are un singur segment genomic de 4,6 kb care codifică principala sa proteină de înveliș, Gag (76 kDa) și o proteină de fuziune Gag-Pol (180 kDa) formată de o deplasare de cadru ribosomal -1. L-A poate susține replicarea și încapsidarea în particule virale separate a oricăruia dintre mai multe ARN ds satelit, numite ARN ds M, fiecare dintre acestea codificând o toxină proteică secretată (toxina ucigașă) și imunitatea la această toxină. L-A și M sunt transmise de la o celulă la alta prin amestecul citoplasmatic care are loc în procesul de împerechere. Niciuna dintre ele nu este eliberată în mod natural din celulă și nici nu pătrunde în celule prin alte mecanisme, dar frecvența ridicată a împerecherii drojdiilor în natură are ca rezultat distribuția largă a acestor virusuri în izolatele naturale. Mai mult, asemănările structurale și funcționale cu virusurile cu ARNdS de la mamifere au făcut utilă considerarea acestor entități ca fiind virusuri.

Virusul bolii bursale infecțioaseEdit

Virusul bolii bursale infecțioase (IBDV) este cel mai bine caracterizat membru al familiei Birnaviridae. Acești viruși au genomuri bipartite de ARNdb închise în capside icosaedrice cu un singur strat cu geometrie T = 13l. IBDV împărtășește strategii funcționale și caracteristici structurale cu multe alte virusuri cu dsARN icosaedrice, cu excepția faptului că nu are nucleul T = 1 (sau pseudo T = 2) comun cu Reoviridae, Cystoviridae și Totiviridae. Proteina capsidală a IBDV prezintă domenii structurale care prezintă o omologie cu cele ale proteinelor capsidale ale unor virusuri cu ARN monocatenar cu sens pozitiv, cum ar fi nodavirusurile și tetravirusurile, precum și cu proteina capsidală T = 13 a Reoviridae. Învelișul T = 13 al capsidei IBDV este format din trimere de VP2, o proteină generată prin îndepărtarea domeniului C-terminal din precursorul său, pVP2. Tăierea pVP2 este efectuată pe particule imature ca parte a procesului de maturare. Cealaltă proteină structurală majoră, VP3, este o componentă multifuncțională situată sub învelișul T = 13, care influențează polimorfismul structural inerent al pVP2. ARN-polimeraza ARN-dependentă codificată de virus, VP1, este încorporată în capsidă prin asocierea sa cu VP3. VP3 interacționează, de asemenea, în mod extensiv cu genomul dsARN viral.

Bacteriofagul Φ6Edit

Bacteriofagul Φ6, este un membru al familiei Cystoviridae. Acesta infectează bacteriile Pseudomonas (de obicei P. syringae patogenă pentru plante). Are un genom ARN bicatenar segmentat în trei părți, cu o lungime totală de ~13,5 kb. Φ6 și rudele sale au o membrană lipidică în jurul nucleocapsidei, o trăsătură rară printre bacteriofagi. Este un fag litic, deși, în anumite circumstanțe, s-a observat că prezintă o întârziere în liză care poate fi descrisă ca o „stare de purtător”.

.