The Human Protein Atlas
On octombrie 19, 2021 by adminFuncția de căutare poate fi utilizată pentru căutare în text liber (introduceți orice în câmpul de căutare) sau pentru interogări mai complexe utilizând „Fields” (vezi exemple).
Cercetarea în text liber va căuta corespondențe complete și parțiale cu nume de gene, sinonime de gene, descrieri de gene, identificatori externi (UniProt, Ensembl, NCBI Entrez Gene) de gene și proteine, clase de proteine, identificatori și descrieri Gene Ontology, identificatori și descrieri de anticorpi și adnotări de imagini. Cuvântul de interogare în text liber trebuie să aibă o lungime de cel puțin trei caractere.
Câmpurile specifice pot fi căutate prin utilizarea funcției „Fields”. Câmpurile disponibile sunt: Numele genei (numele HGNC sau sinonime), clasa proteinei, cromozomul, identificatorul extern (identificatorul genei Ensembl, al transcripției sau al proteinei, numărul de acces UniProt, identificatorul genei NCBI Entrez), localizarea subcelulară bazată pe colorarea prin imunofluorescență în trei linii celulare diferite, organul-, țesutul-, Cancer- și expresia liniei celulare, rezultatele validării anticorpilor în patru teste diferite (IH=imunohistochimie, IF=imunofluorescență, WB=Western blot, PA=proteine array), scoruri de evidență și o filtrare a genelor numai cu anticorpi și a genelor cu expresie proteică adnotată pe baza cunoștințelor (IH, IF).
Lasă un răspuns