Microflora tractului gastrointestinal: o trecere în revistă

Suprafața mucoasă a tractului gastrointestinal (GI) uman este de aproximativ 200-300 m2 și este colonizată de 1013-14 bacterii din 400 de specii și subspecii diferite. Savage a definit și clasificat microflora gastrointestinală în două tipuri, flora autohtonă (flora indigenă) și flora alohtonă (flora tranzitorie). Microorganismele autohtone colonizează anumite habitate, adică spațiile fizice din tractul gastrointestinal, în timp ce microorganismele alohtone nu pot coloniza anumite habitate decât în condiții anormale. Majoritatea agenților patogeni sunt microorganisme alohtone; cu toate acestea, unii agenți patogeni pot fi autohtoni în ecosistem și trăiesc în mod normal în armonie cu gazda, cu excepția cazului în care sistemul este perturbat. Prevalența bacteriilor în diferite părți ale tractului gastrointestinal pare să depindă de mai mulți factori, cum ar fi pH-ul, peristaltismul, potențialul redox, aderența bacteriană, cooperarea bacteriană, secreția de mucină, disponibilitatea nutrienților, dieta și antagonismul bacterian. Din cauza pH-ului scăzut al stomacului și a peristaltismului relativ rapid prin stomac și intestinul subțire, stomacul și cele două treimi superioare ale intestinului subțire (duodenul și jejunul) conțin doar un număr redus de microorganisme, care variază între 103 și 104 bacterii/mL de conținut gastric sau intestinal, în principal lactobacili și streptococi toleranți la acizi. În partea distală a intestinului subțire (ileon), microflora începe să semene cu cea din colon, cu aproximativ 107-108 bacterii/mL din conținutul intestinal. Cu un peristaltism scăzut, aciditate și potențiale de oxido-reducere mai scăzute, ileonul menține o microflora mai diversă și o populație bacteriană mai mare. Probabil din cauza motilității intestinale lente și a potențialelor de oxidare-reducere foarte scăzute, colonul este principalul loc de colonizare microbiană la om. Colonul adăpostește un număr și specii enorme de bacterii. Cu toate acestea, 99,9% din microflora colonică sunt anaerobi obligați.