The Human Protein Atlas

De zoekfunctie kan worden gebruikt voor het zoeken in vrije tekst (typ om het even wat in het zoekveld), of voor meer complexe query’s met behulp van “Velden” (zie voorbeelden).
Het zoeken in vrije tekst zoekt naar volledige en gedeeltelijke overeenkomsten met gennamen, gen-synoniemen, gen-beschrijvingen, externe (UniProt, Ensembl, NCBI Entrez Gene) gen- en eiwit-identifiers, eiwitklassen, Gene Ontology-identifiers en -beschrijvingen, antilichaam-identifiers en beeldannotaties. Het querywoord in vrije tekst moet ten minste drie tekens lang zijn.
Specifieke velden kunnen worden doorzocht met behulp van de “Fields”-functie. Beschikbare velden zijn: Gennaam (HGNC-naam of synoniemen), Eiwitklasse, Chromosoom, Externe identifier (Ensembl-gen, transcript of eiwit-identifier, UniProt-toetredingsnummer, NCBI Entrez-gen-identifier), Subcellulaire locatie op basis van immunofluorescente kleuring in drie verschillende cellijnen, Orgaan-, Weefsel-, Kanker- en cellijn expressie, Antilichaam validatie resultaten in vier verschillende assays (IH=immunohistochemie, IF=immunofluorescentie, WB=Western blot, PA=Protein array), bewijs scores en een filtering op Genen met alleen antilichamen en Genen met op kennis gebaseerde geannoteerde eiwitexpressie (IH, IF).