Boku wa Imōto ni Koi o Suru

Yori en Iku Yuki zijn tweelingbroers en -zussen, die al sinds hun geboorte een hechte band hebben. Tijdens hun kindertijd vertelde Yori hun ouders dat hij met Iku zou trouwen. Terwijl hun ouders dit afdeed als een onschuldige kinderfantasie, wist Yori dat zijn gevoelens meer waren dan een onschuldige verliefdheid op zijn zus. Nu ze vijftien zijn, zijn zijn gevoelens sterker geworden dan voorheen. Yori heeft inmiddels begrepen dat hij diep en hopeloos verliefd is geworden op Iku, waardoor hij zich schaamt. Omdat ze een slaapkamer delen, vindt Yori het steeds moeilijker om zijn gevoelens voor haar te weerstaan, dus begint hij zich van haar te distantiëren en doet hij kil tegen haar. Iku is gekwetst en geschokt door zijn harde aanpak, maar ze probeert vrolijk te blijven en hem aan het lachen te maken. Op een dag raakt Yori tijdens schooltijd in gevecht nadat een klasgenoot Iku uitlacht en raakt gewond. Tomoka Kusunoki, Iku’s beste vriendin, verzorgt zijn verwonding en probeert hem te troosten. In het midden van dit alles, kust ze hem plotseling en verklaart haar liefde aan hem. Als ze hem vraagt of ze goed genoeg voor hem is, ziet hij dit als een kans om zijn gevoelens voor Iku te overtreffen. Hij kust haar en heeft seks met haar in een hotel. Deze ontmoeting helpt hem echter niet om zijn lust voor Iku te vergeten. Tomoka denkt ten onrechte dat Yori haar gevoelens beantwoordt en noemt hem haar vriend. Yori besluit dit echter voor Iku te verbergen, zodat ze niet boos wordt. Later probeert hij een nieuwe strategie: naar een middelbare school buiten de stad gaan. Dagen later krijgen Yori en Iku ruzie nadat Iku praat over haar dromen om een vriendje te hebben en op date te gaan. Yori wordt hier heel boos over en schreeuwt tegen Iku dat ze haar mond moet houden. Iku doet dat, maar begint te huilen. Terwijl ze huilt, kust hij haar, wat haar shockeert, en hij biecht haar zijn liefde op. Iku is verbaasd over zijn bekentenis en wijst zijn avances af omdat hij haar broer is. Zij ziet echter het verdriet op zijn gezicht en beseft dat, hoewel zij niet zeker weet of zij meer van hem houdt dan van een broer, zij hem kan verliezen door hem af te wijzen. Ze kust hem en voelt zich daardoor ongemakkelijk, wat Yori opmerkt en haar zegt te wachten tot ze zeker is van haar liefde voor hem. Gedurende de volgende dagen proberen ze een intieme relatie te beginnen, waarbij Iku zich langzaam aanpast aan Yori’s avances en hun ouders in het ongewisse laat. Haruka Yano, Yori’s beste vriendin, merkt de toenadering van de tweeling onmiddellijk op, maar vertelt het hen niet. Iku blijft verscheurd tussen haar schuldgevoel over het plegen van een tweeling en haar verlangen om samen te blijven met Yori. Haar schuldgevoel verdwijnt echter volledig wanneer ze ontdekt dat Yori van plan is zich in te schrijven op een andere middelbare school en dat hij Tomoka heeft ontmoet. Ze probeert seks te hebben met Yori, maar in het proces wijst hij haar af omdat ze nog steeds niet van hem houdt. De volgende dag, als ze ziet dat Tomoka zich vastklampt aan Yori, realiseert Iku zich dat ze eindelijk verliefd is geworden op Yori. Nadat ze het hem opgebiecht hebben, spijbelen ze en vluchten naar een kerk, waar ze nog gespeeld hebben toen ze klein waren. Ze proberen seks te hebben in de kerk, maar Iku zegt hem te stoppen omdat ze voelt dat God hen in de gaten houdt. Yori stemt toe en besluiten naar huis te gaan.

Tomoka praat kort daarna tijdens school met Iku en hun vrienden over haar eerste keer met Yori, wat Iku boos maakt. Yori komt binnen en vertelt Tomoka dat hun relatie voorbij is voordat ze met Iku vertrekt. Tomoka lacht terwijl ze huilt en begrijpt niet waarom hij het zo plotseling met haar heeft uitgemaakt. Als iemand zegt dat Yori waarschijnlijk iemand anders heeft die hij leuk vindt, realiseert ze zich snel dat die persoon Iku is. Iku maakt ruzie met Yori over zijn indiscretie met Tomoka. Hij omhelst haar als ze probeert bij hem weg te komen, maar als ze hem ziet huilen, geeft ze toe aan haar gevoelens en omhelst hem terug. Later die dag laat Iku Yori met haar afspreken en vertelt hem dat ze nu met hem wil vrijen, wat hem schokt maar plezier doet. Ze gaan naar een hotel, en nadat Iku aanvankelijk ongerust is, hebben ze eindelijk voor de eerste keer seks. Yori is blij dat Iku van hem is, maar voelt zich schuldig en vraagt God om alleen hem te straffen. Dagen later studeren ze af aan de middelbare school en Iku realiseert zich dat Yori nog steeds van plan is om naar een andere middelbare school te gaan. Yori vertelt Yano de waarheid over zijn relatie met Iku, wat Yano wist, maar hij vraagt waarom hij nog steeds weggaat. Yori zegt dat hij verscheurd is tussen zijn verlangen om deze relatie te beschermen versus de verplichting om deze te vernietigen. Yori probeert Iku te troosten, die vraagt waarom hij wil gaan. Yori zegt dat hij niet weg wil, maar als hij blijft, kunnen ze geen normaal stel zijn. Maar als ze in een andere stad waren, waar niemand hen kent, zouden ze een stel kunnen zijn. Iku stemt er met tegenzin mee in om hem te laten gaan, met de belofte dat ze contact zullen houden.

Yori komt aan op zijn middelbare school, en tot zijn schrik ontdekt hij dat Tomoka zich op dezelfde school heeft ingeschreven. Ze probeert hem over te halen haar terug te nemen, maar hij wijst haar af, wat haar niet lijkt te deren. Voor hun zestiende verjaardag krijgen Yori en Iku een mobiele telefoon, waardoor ze gemakkelijker contact kunnen houden. Iku bezoekt Yori zo veel mogelijk omdat Yori buiten de school maar beperkt bezoek mag ontvangen. Hij raakt bevriend met Takuma Kakinouchi en diens vriendin Mayu Taneda, die als zijn vertrouwelingen fungeren. Als verjaardagscadeau geeft Yori Iku een diamanten klaverring als belofte van eeuwige liefde. Wekenlang van Yori gescheiden, wordt Iku onder de hoede van Yano geplaatst, die als haar beschermer optreedt. Yano helpt de tweeling om elkaar op school te zien en regelt zelfs dat ze de nacht samen doorbrengen. Wanneer hij Iku vertelt dat hij weet van de relatie, verzekert hij haar dat hij het geheim zal houden. Maar als hij tijd met haar doorbrengt, wordt Yano langzaam verliefd op Iku. Yori zweert dat hij Iku nooit zal opgeven, en de twee beste vrienden hebben een vriendschappelijke rivaliteit over Iku, die zich niet bewust is van Yano’s gevoelens. De ouders van de tweeling zien Yano aan voor Iku’s vriendje en zijn meteen weg van hem, maar hij zegt dat ze geen stel zijn. Als hij Iku toch vertelt dat hij haar leuk vindt, wijst Iku hem af omdat ze van Yori houdt.

Yori realiseert zich al snel dat Tomoka vastbesloten is wraak te nemen op hem en Iku omdat ze het met haar uitgemaakt heeft. Ze laat hen meerdere malen door medestudenten betrappen in Yori’s kamer om hem van school te sturen, want het is voor meisjes verboden in jongensslaapzalen te zijn. Als Yori lichte straffen krijgt voor de overtredingen, maakt ze een foto van de zoenende twee op haar mobieltje en dreigt ze die naar iedereen te sturen die ze kennen als hij niet met haar naar bed gaat. Als hij de deal lijkt te accepteren, verwijdert hij de foto en zegt dat ze hem en Iku met rust moet laten. Tomoka weigert echter te luisteren en gaat door met haar plan om hem uit te wijzen. Enige tijd later, terwijl Yano in Iku’s huis is, komt haar vader thuis en vertelt zijn vrouw blij dat hij hun oude vriend, Dr. Yuugo Mori, tegen het lijf is gelopen, wat haar verbaast. Hij vertelt haar dat Yuugo een dochter heeft die even oud is als Yori en Iku, en beloofd heeft om Yori met het meisje te laten verloven. De moeder van de tweeling weigert dit en vraagt naar wanneer hij gezegd heeft dat het meisje op Yori lijkt. Dit klinkt verdacht voor Yano, die Yori vertelt dat hij denkt dat Iku misschien niet zijn zuster is. Yori wijst deze mogelijkheid af, ook al hoopt hij stiekem dat het waar is. Wanneer Iku de school binnensluipt om Yori te bezoeken, huurt Tomoka een groep klasgenoten om Iku te verkrachten. Gelukkig betrapt Yori hen en straft hen en Tomoka. De schooldirecteur besluit Yori van school te sturen omdat hij Iku nog steeds in zijn slaapzaal laat. Iku is blij met het nieuws, wat Tomoka ergert en haar dom noemt. Yori verdedigt Iku tegen Tomoka’s belediging, en ze dreigt zijn moeder te vertellen over de tweelingzus-relatie. Hij gelooft haar niet, maar de tweeling ontdekt dat hun moeder het gesprek heeft afgeluisterd. Yano liegt opnieuw en zegt dat Tomoka een grapje maakte en dat Iku zijn vriendin is. Hun moeder gelooft hen niet, maar zegt het niet uit angst, en neemt de tweeling mee naar huis. Yori schrijft zich in op Iku’s middelbare school, waar ze Yuugo’s dochter Azusa ontmoeten. Zij merkt op dat Yori en Iku niet op elkaar lijken, terwijl zij precies op Yori lijkt. Azusa vertelt haar vader hoe verschillend de tweeling is, en nadat hij de familie Yuki bij hem thuis uitnodigt en hij Yori voor het eerst ziet, confronteert hij hun moeder. Yori is getuige van een intiem moment tussen de twee en vermoedt dat ze misschien een affaire hebben gehad. Later vindt hij Iku’s oningevulde geboorteakte en foto’s van zijn ouders met Yuugo. Azusa bekent Yori dat ze denkt dat ze halfbroers en halfzussen zijn, en dan bekent Yuugo dat hij al sinds zijn schooltijd verliefd is op Yori’s moeder en dat hij gelooft dat hij Yori’s biologische vader is. Hij gebruikt stiekem een stukje van Yori’s haar om een DNA-test te doen, die zijn vermoedens bevestigt. Hij vertelt het nieuws aan de moeder van de tweeling en is geschokt als ze toegeeft dat ze weet dat Yori zijn zoon is. Ze had het geheim gehouden uit angst haar familie te ruïneren. Yori en Yano raadplegen een familievriend van Yano, die zegt dat de oningevulde geboorteakte erop zou kunnen wijzen dat Iku als kind in de steek is gelaten en daarna door hun ouders is geadopteerd. Hierna maakt Yori zijn gevoelens voor Iku duidelijk aan zijn moeder, die geschokt reageert. Ze vertelt Yori dat hij uit de buurt van Iku moet blijven omdat ze broers en zussen zijn. Yori gelooft haar niet en dreigt de familie te vernietigen als ze iemand over de relatie vertelt. Terwijl zijn moeder ontzet is, neemt hij Iku mee naar hun kamer. Terwijl ze de liefde bedrijven, confronteert hun moeder hen en vertelt hen dat ze broers en zussen zijn, maar Yori vraagt haar antwoord te geven op zijn vraag over Iku’s geboorteakte. Ze vertelt de tweeling en hun vader dat ze een tweeling zijn, maar een half-tweeling; ze zijn het resultaat van heteropaternal superfecundation. Ze vertelt hen dat Yori haar zoon is bij Yuugo Mori en Iku haar dochter bij haar man. Zestien jaar geleden, toen zij op het punt stond met haar man te trouwen, bekende Yuugo haar zijn liefde, en hoewel zij gevoelens voor hem had, weigerde zij hem. Op dat moment kuste hij haar en hadden ze seks. Ze probeerde het verraad te vergeten en sliep diezelfde dag nog met haar man. Drie maanden later ontdekte ze dat ze zwanger was van een tweeling en ze wist niet zeker wie de vader was, totdat de tweeling werd geboren en ze het fysieke verschil tussen hen zag. Ze wordt lichamelijk ziek na het vertellen van het verhaal en haalt uit naar Yori voor zijn tweeling met Iku.

Zich realiserend dat ze van elkaar gescheiden kunnen worden nu hun ouders hun geheim kennen, lopen Yori en Iku weg van huis met Yano’s hulp en verblijven in zijn strandhuisje. Yori vertelt Iku dat als ze samen een kind zouden krijgen, hun ouders hen nooit zouden hoeven scheiden. Iku aarzelt bij dit idee, maar stemt toe, en ze bedrijven de liefde in een poging zwanger te worden. Later gaan ze naar een kerk om te bidden, en Yori realiseert zich dat Iku hun familie niet kan opofferen om bij hem te zijn en besluit dat het het beste is om de relatie te beëindigen. Ze besluiten naar huis terug te keren en zich te verzoenen met hun ouders. Yori besluit de familie te verlaten en ergens heen te gaan waar hij nooit gevonden kan worden, zodat zijn gevoelens en die van Iku zullen vervagen. Voordat hij vertrekt, knipt hij Iku’s haar af van hoe het eruit zag in haar kindertijd op haar verzoek, en hij glipt uit als ze in slaap valt. Als ze wakker wordt en merkt dat hij weg is, raakt Iku in een diepe depressie. Ze realiseert zich echter al snel dat ze nooit iets voor Yori heeft gedaan en besluit hem te vinden, hoe lang dat ook mag duren. In de volgende tien jaar slaagt Iku erin aan een universiteit te studeren en wordt ze vertegenwoordiger voor Yano’s bedrijf. Yano heeft Iku vaak ten huwelijk gevraagd, maar zij wijst hem af. Tijdens een reis naar Engeland gaat ze naar een bibliotheek omdat ze denkt dat Yori daar ook heen zou gaan. Uiteindelijk passeren ze elkaar, maar herkennen elkaar pas na een paar seconden, en draaien zich om en omhelzen elkaar. In de climax verklaart Yori dat hij nog steeds verliefd is op Iku.