Protein-protein interaction networks

Protein-protein interaction (PPI) は細胞内のほぼすべてのプロセスに不可欠であり、PPIの理解は正常および疾病状態における細胞生理学を理解する上で非常に重要である。 また、薬剤がPPIに影響を与える可能性があるため、薬剤開発においても不可欠である。 タンパク質間相互作用ネットワーク（PPIN）は、細胞内のタンパク質間の物理的な接触を数学的に表現したものです。 これらの接触は、

• 特異的である
• タンパク質中の定義された結合領域間に生じる
• 特定の生物学的意味を持つ（すなわち,
  • 一過性の相互作用は、タンパク質複合体（例：リボソーム、ヘモグロビン）
  • 一過性の相互作用は、タンパク質を修正または運搬し、さらなる変化をもたらす短い相互作用です（例：タンパク質キナーゼ、核膜インポーティンなど）。 これらはインタラクトームの最も動的な部分を構成する

  PPIに関する知識は、次のことに利用できる。

  • 未知のタンパク質に推定される役割を割り当てる
  • シグナル伝達経路内のステップについて詳細な情報を加える
  • プロテアソームなどの複数分子複合体を形成するタンパク質間の関係を明らかにする

  インタラクソーム

  細胞、生物、特定の生物的状況で発生する相互作用を網羅するもので、その総数は、1つの細胞で1つのタンパク質が2回、3回、またはそれ以上の相互作用を行うことができる。 大規模なPPIスクリーニング技術、特に質量分析と酵母ツーハイブリッドアッセイを組み合わせたハイスループット親和性精製の開発により、PPIデータの量が爆発的に増加し、これまで以上に複雑で完全なインタラクトームが構築されるようになった（図16）。 このような実験的証拠に加え、PPI予測アルゴリズムが利用できるようになりました。 この情報の多くは、IntActのような分子間相互作用データベースから入手可能である。

  

  利用可能なPPIデータの限界をもう一度強調することが重要である。 インタラクトームに関する我々の現在の知識は不完全であり、ノイズも多い。 PPI検出法には、本当に生理的な相互作用をいくつ検出できるかという限界があり、すべて偽陽性と偽陰性が見つかります。

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  Protein Interactions and their importance

  IntAct.PROINT (PPI)を受講してください。 EMBL-EBIの分子間相互作用データベース：ウェビナー

  IntAct.DB（英語）

  IntAct.DB（英語）8869 Molecular interactions at EMBL-EBI

  次のページでは、タンパク質-タンパク質相互作用ネットワークの特性と、これらの特性が生物学に与える影響について見ていきます

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