The Human Protein Atlas

La funzione di ricerca può essere utilizzata per la ricerca a testo libero (digitare qualsiasi cosa nel campo di ricerca), o per query più complesse utilizzando “Fields” (vedi esempi).
La ricerca a testo libero cercherà corrispondenze complete e parziali con nomi di geni, sinonimi di geni, descrizioni di geni, identificatori di geni e proteine esterni (UniProt, Ensembl, NCBI Entrez Gene), classi di proteine, identificatori e descrizioni di Gene Ontology, identificatori di anticorpi e annotazioni di immagini. La parola di interrogazione a testo libero deve essere lunga almeno tre caratteri.
Campi specifici possono essere ricercati usando la funzione “Fields”. I campi disponibili sono: Nome del gene (nome HGNC o sinonimi), classe della proteina, cromosoma, identificatore esterno (identificatore del gene, del trascritto o della proteina Ensembl, numero di adesione UniProt, identificatore del gene NCBI Entrez), localizzazione subcellulare basata sulla colorazione immunofluorescente in tre diverse linee cellulari, espressione in organo, tessuto, Espressione di linee cellulari e tumorali, risultati della convalida degli anticorpi in quattro diversi test (IH=immunoistochimica, IF=immunofluorescenza, WB=Western blot, PA=Protein array), punteggi di evidenza e un filtraggio sui geni con soli anticorpi e geni con espressione proteica annotata basata sulla conoscenza (IH, IF).