Microflora del tratto gastrointestinale: una revisione

La superficie della mucosa del tratto gastrointestinale umano (GI) è circa 200-300 m2 ed è colonizzata da 1013-14 batteri di 400 specie e sottospecie diverse. Savage ha definito e classificato la microflora gastrointestinale in due tipi, flora autoctona (flora indigena) e flora alloctona (flora transitoria). I microrganismi autoctoni colonizzano particolari habitat, cioè gli spazi fisici nel tratto gastrointestinale, mentre i microrganismi alloctoni non possono colonizzare particolari habitat se non in condizioni anormali. La maggior parte dei patogeni sono microrganismi alloctoni; tuttavia, alcuni patogeni possono essere autoctoni dell’ecosistema e vivere normalmente in armonia con l’ospite, tranne quando il sistema è disturbato. La prevalenza dei batteri in diverse parti del tratto gastrointestinale sembra dipendere da diversi fattori, come il pH, la peristalsi, il potenziale redox, l’adesione batterica, la cooperazione batterica, la secrezione di mucina, la disponibilità di nutrienti, la dieta e l’antagonismo batterico. A causa del basso pH dello stomaco e della peristalsi relativamente rapida attraverso lo stomaco e l’intestino tenue, lo stomaco e i due terzi superiori dell’intestino tenue (duodeno e digiuno) contengono solo un basso numero di microrganismi, che vanno da 103 a 104 batteri/mL del contenuto gastrico o intestinale, principalmente lattobacilli e streptococchi tolleranti all’acido. Nell’intestino tenue distale (ileo), la microflora comincia ad assomigliare a quella del colon, con circa 107-108 batteri/mL del contenuto intestinale. Con una minore peristalsi, acidità e potenziali di ossido-riduzione più bassi, l’ileo mantiene una microflora più diversificata e una popolazione batterica più elevata. Probabilmente a causa della lenta motilità intestinale e dei potenziali di ossido-riduzione molto bassi, il colon è il sito primario della colonizzazione microbica negli esseri umani. Il colon ospita un enorme numero e specie di batteri. Tuttavia, il 99,9% della microflora del colon sono anaerobi obbligati.