The Human Protein Atlas
On október 19, 2021 by adminA keresési funkció használható szabad szöveges keresésre (írjon be bármit a keresőmezőbe), vagy összetettebb lekérdezésekhez a “Mezők” használatával (lásd a példákat).
A szabad szöveges keresés teljes és részleges egyezéseket keres génnevekre, génszinonimákra, génleírásokra, külső (UniProt, Ensembl, NCBI Entrez Gene) gén- és fehérjeazonosítókra, fehérjeosztályokra, Gene Ontology azonosítókra és leírásokra, antitestazonosítókra és képi annotációkra. A szabad szöveges keresőszónak legalább három karakter hosszúnak kell lennie.
Specifikus mezőkben a “Fields”-funkcióval lehet keresni. A rendelkezésre álló mezők a következők: Génnév (HGNC név vagy szinonimák), fehérjeosztály, kromoszóma, külső azonosító (Ensembl gén-, transzkript- vagy fehérjeazonosító, UniProt csatlakozási szám, NCBI Entrez génazonosító), immunfluoreszcens festésen alapuló szubcelluláris elhelyezkedés három különböző sejtvonalban, szerv-, szövet-, Rák- és sejtvonalbeli expresszió, antitest validációs eredmények négy különböző vizsgálatban (IH=immunhisztokémia, IF=immunofluoreszcencia, WB=Western blot, PA=Protein array), evidencia pontszámok és szűrés a csak antitestekkel rendelkező génekre és a tudásalapú annotált fehérjeexpresszióval rendelkező génekre (IH, IF).
Vélemény, hozzászólás?