Microflora of the gastrointestinal tract: a review

Az emberi gyomor-bél traktus (GI) nyálkahártya felszíne körülbelül 200-300 m2, és 400 különböző faj és alfaj 1013-14 baktériuma kolonizálódik. Savage a gasztrointesztinális mikroflórát két típusra, autochton flórára (őshonos flóra) és allochton flórára (átmeneti flóra) definiálta és kategorizálta. Az autochton mikroorganizmusok bizonyos élőhelyeket, azaz a GI-traktus fizikai tereit kolonizálják, míg az allochton mikroorganizmusok csak rendellenes körülmények között tudnak megtelepedni bizonyos élőhelyeken. A legtöbb kórokozó allochton mikroorganizmus; mindazonáltal néhány kórokozó lehet autochton az ökoszisztémában, és általában harmóniában él a gazdaszervezettel, kivéve, ha a rendszert megzavarják. Úgy tűnik, hogy a baktériumok előfordulása a GI-traktus különböző részein számos tényezőtől függ, mint például a pH, a perisztaltika, a redox-potenciál, a bakteriális adhézió, a bakteriális együttműködés, a mucinszekréció, a tápanyagok elérhetősége, a táplálkozás és a bakteriális antagonizmus. A gyomor alacsony pH-ja és a gyomor és a vékonybél viszonylag gyors perisztaltikája miatt a gyomor és a vékonybél felső kétharmada (duodenum és jejunum) csak alacsony számú mikroorganizmust tartalmaz, amely 103 és 104 baktérium/ml között mozog a gyomor- vagy béltartalomban, főként savtoleráns laktobacilusokat és streptococcusokat. A disztális vékonybélben (ileum) a mikroflóra kezd hasonlítani a vastagbéléhez, körülbelül 107-108 baktériummal/ml béltartalomban. A csökkent perisztaltika, savasság és alacsonyabb oxidációs-redukciós potenciálok miatt az ileum változatosabb mikroflórát és magasabb baktériumpopulációt tart fenn. Valószínűleg a lassú bélmozgás és a nagyon alacsony oxidációs-redukciós potenciálok miatt a vastagbél a mikrobiális kolonizáció elsődleges helye az emberben. A vastagbél óriási számú és fajú baktériumnak ad otthont. A vastagbél mikroflórájának 99,9%-a azonban obligát anaerob.