Az Angelman, Prader-Willi diagnosztikai teszt gyors, pontos és kevésbé drága
On január 5, 2022 by adminKutatók új, gyors és pontos molekuláris diagnosztikai tesztet fejlesztettek ki az Angelman- és Prader-Willi-szindrómás betegek számára.
A “Gyors és pontos metiláció-érzékeny, nagy felbontású olvadáselemző vizsgálat a Prader-Willi és Angelman betegek diagnosztizálására” című tanulmányuk a Molecular Genetics & Genomic Medicine című szaklapban jelent meg.
A Prader-Willi (PWS) és az Angelman (AS) szindróma két ritka genetikai rendellenesség, amelyet a 15. kromoszóma azonos régiójának imprinting-hibái okoznak. Míg a PWS az apai gének funkcióvesztésével jár, addig az Angelman-szindrómát az anyai gének funkcióvesztése okozza. A genomiális imprinting az a folyamat, amelynek során egy gén egyik példányát – akár az anyai, akár az apai példányt – egy metilációnak nevezett kémiai DNS-módosítással elnémítják.
“A PWS és az AS laboratóriumi diagnózisa kihívást jelent, és számos molekuláris és citogenetikai módszert igényel a szindróma kialakulásához vezető genetikai mechanizmus tisztázásához” – írták a kutatók.
A 15. kromoszóma egy meghatározott régiójában – az úgynevezett SNURF-SNRPN lókuszban – a DNS-metilációs mintázatok elemzése metiláció-specifikus polimeráz láncreakcióval (MS-PCR, a DNS-szekvencia meghatározott régióiban a DNS-metiláció változását kimutató technika) lehetővé teszi a kutatók számára a PWS-ben és az AS-ben szenvedő betegek diagnosztizálását és megkülönböztetését.
“Bár a DNS-szekvenálást a mutációszűrés “arany standardjának” tekintik, ez a módszer továbbra is viszonylag drága, munkaigényes és időigényes” – írták a kutatók.
A tanulmányban a tudósok egy nagy felbontású olvadáson alapuló módszert dolgoztak ki (HRM, egy olyan technika, amely lehetővé teszi a kutatók számára, hogy az olvadási profiljuk alapján megkülönböztessék a normál és a mutált DNS-szekvenciákat). Ez egy egyszerű, gyors, érzékeny, specifikus és olcsó alternatívája a DNS-szekvenálásnak a PWS és AS betegek diagnosztizálására és megkülönböztetésére.
Az új MS-HRM módszer teszteléséhez és validálásához a kutatók először 43 olyan beteg vérmintájából izoláltak DNS-t, akiknél felmerült a PWS vagy AS gyanúja. Ezután elvégezték és összehasonlították a standard MS-PCR és az új MS-HRM módszer eredményeit.
A vizsgálati eredmények azt mutatták, hogy az MS-HRM és az MS-PCR minden esetben megegyezett, 19 (44%) PWS-es, három (7%) AS-es és 21 (49%) elváltozást nem mutató beteget azonosítva.
A 19 (44%) betegen elvégzett fluoreszcens in situ hibridizáció (FISH, egy olyan technika, amely lehetővé teszi a kutatók számára a kromoszómák fluoreszcens szondával megjelölt specifikus régióinak láthatóvá tételét) négy esetben mutatott ki PWS-t, amelyet a 15-ös kromoszóma deléciója (amikor egy gén DNS-szekvenciájának egy része elvész) okozott.
Az MS-HRM “nem igényel további technikákat, például agaróz gélelektroforézist , csökkentve a pontos eredmény eléréséhez szükséges időt és a minták közötti keresztszennyeződés kockázatát” – írták a kutatók.
“Az MS-HRM érzékenysége lehetővé teszi a minta apró töredékének kimutatását, ami fontos az olyan minták elemzésében, amelyeket nehéz beszerezni, különösen az újszülött hipotóniás csecsemőkből. Emellett a HRM magas reprodukálhatósága alkalmassá teszi ezt a módszert mind kutatási, mind diagnosztikai célokra a PWS és AS szindrómák vizsgálatában” – tették hozzá.”
“A PWS vagy AS gyors és pontos diagnózisa lehetővé teszi a hatékony gyógyszeres beavatkozást, elkerülve e rendellenességek számos jellegzetességét, jobb életminőséget biztosítva” – összegezték.
- A szerző adatai
Vélemény, hozzászólás?