The Human Protein Atlas
On octobre 19, 2021 by adminLa fonction de recherche peut être utilisée pour une recherche en texte libre (tapez n’importe quoi dans le champ de recherche), ou pour des requêtes plus complexes en utilisant les « Champs » (voir exemples).
La recherche en texte libre recherchera des correspondances complètes et partielles avec des noms de gènes, des synonymes de gènes, des descriptions de gènes, des identifiants de gènes et de protéines externes (UniProt, Ensembl, NCBI Entrez Gene), des classes de protéines, des identifiants et des descriptions de Gene Ontology, des identifiants d’anticorps et des annotations d’images. Le mot de requête en texte libre doit comporter au moins trois caractères.
Des champs spécifiques peuvent être recherchés en utilisant la fonction « Fields ». Les champs disponibles sont : Nom du gène (nom HGNC ou synonymes), classe de protéine, chromosome, identifiant externe (identifiant de gène, de transcription ou de protéine Ensembl, numéro d’accession UniProt, identifiant de gène NCBI Entrez), localisation subcellulaire basée sur la coloration immunofluorescente dans trois lignées cellulaires différentes, expression d’organe, de tissu, Cancer- et expression de la lignée cellulaire, Résultats de validation des anticorps dans quatre essais différents (IH=immunohistochimie, IF=immunoflourescence, WB=Western blot, PA=Protein array), scores de preuve et un filtrage sur les Gènes avec anticorps uniquement et les Gènes avec expression protéique annotée basée sur la connaissance (IH, IF).
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