Salmonella enterica spp (anciennement Salmonella choleraesuis)

Salmonella enterica spp (anciennement Salmonella choleraesuis)

FICHE DE DONNÉES DE SÉCURITÉ PATHOGÈNE – SUBSTANCES INFECTIEUSES

SECTION I – AGENT INFECTIEUX

NOM : Salmonella enterica spp. (anciennement Salmonella choleraesuis)

SYNONYME OU RÉFÉRENCE CROISÉE : Salmonella enterica spp. – Salmonellose.

Sérotype Typhi – Fièvre typhoïde, fièvre entérique, typhus abdominalis, Salmonella enterica sérotype Typhi.

Sérotype Choleraesuis – Septicémie à Salmonella, choléra du porc, typhoïde du porc, Samonella enterica sérotype Choleraesuis, salmonellose.

Sérotype Paratyphi – Fièvre entérique, fièvre paratyphoïde, Salmonella Paratyphi type A, B et C, Salmonella enterica sérotype Paratyphoïde A, B et C.

CHARACTÉRISTIQUES : Salmonella enterica est l’une des deux espèces de Salmonella (enterica et bongori) et un membre de la famille des Enterobacteriaceae (1, 2). Salmonella enterica spp. est subdivisée en 6 sous-espèces (enterica (I), salamae (II), arizonae (IIIa), diarizonae (IIIb), houtenae (IV) et indica (VI) ). L’habitat habituel de la sous-espèce enterica (I) est constitué par les animaux à sang chaud (1-3). Les sous-espèces II, IIIa, IIIb, IV et VI ont pour habitat habituel les animaux à sang froid et l’environnement (2). Toutes les espèces de Salmonella peuvent infecter l’homme. La sous-espèce Salmonella enterica compte 2610 sérotypes différents, les plus connus étant les sérotypes Typhi, Paratyphi, Enteriditis, Typhimurium et Choleraesuis (1). Les sérotypes sont caractérisés par trois antigènes de surface : l’antigène flagellaire « H », l’antigène oligosaccharidique « O » et l’antigène polysaccharidique « Vi » (présent dans les sérotypes Typhi et Paratyphi) (4). Salmonella enterica est un anaérobe facultatif et est un bâtonnet gram négatif, mobile et non sporulant, d’une taille de 0,7 à 1,5 par 2,0 à 5,0 µm (4-6).

SECTION II – IDENTIFICATION DES DANGERS

PATHOGÉNICITÉ/TOXICITÉ : Salmonella enterica peut provoquer quatre manifestations cliniques différentes : gastro-entérite, bactériémie, fièvre entérique et état de porteur asymptomatique (7). Elle est plus fréquente chez les enfants de moins de 5 ans, les adultes de 20 à 30 ans et les patients de 70 ans ou plus (7).

Gastro-entérite : La gastro-entérite ou « intoxication alimentaire » est généralement caractérisée par des nausées soudaines, des vomissements, des crampes abdominales, de la diarrhée, des maux de tête des frissons et une fièvre pouvant atteindre 39 ºC (6-9). Les symptômes peuvent être légers ou graves et durer entre 5 et 7 jours (7, 8). Le sérotype Typhimurium est la cause la plus fréquente de gastro-entérite et on estime à 1,3 milliard le nombre de cas et à 3 millions le nombre de décès annuels (1,4 million de cas et 600 décès rien qu’aux États-Unis) dus à la Salmonella non typhoïde (2, 9, 10). Dans les pays disposant de ressources suffisantes et présentant de faibles niveaux de complications invasives, le taux de mortalité dû aux salmonelles non typhoïdiques est inférieur à 1 % (10) ; cependant, dans les pays en développement, le taux de mortalité peut atteindre 24 % (10).

Bactériémie : La bactériémie survient chez 3 à 10% des individus infectés par Salmonella enterica et certains sérotypes (en particulier le sérotype Choleraesuis) ont des taux de mortalité plus élevés (4, 11). Les personnes immunodéprimées et les patients souffrant de maladies concomitantes (par exemple, VIH-SIDA, diabète, mellitus, tumeur maligne, corrhose, maladie granulomateuse chronique, drépanocytose, maladie lymphoproliférative ou maladie vasculaire du collagène) ont un risque plus élevé de développer une bactériémie due à une infection à Salmonella (4, 7). La bactériémie peut provoquer un choc septique, une endocardite, en particulier chez les patients âgés de plus de 50 ans ou présentant des troubles cardiaques, une infection de l’aorte, en particulier chez les patients présentant une maladie athérosclérotique préexistante, des infections du foie, de la rate et des voies biliaires chez les patients présentant des anomalies structurelles sous-jacentes ; lymphadénite mésentérique ; ostéomyélite des os longs et des vertèbres ; infection des voies urinaires ; pneumonie ; abcès pulmonaire ; abcès cérébral ; empyème sous-dural et épidural ; méningite ; infections du SNC (rarement) ; et décès (4, 7).

Fièvre entérique : Également appelée fièvre typhoïde, cette infection est causée par les sérotypes Typhi et Paratyphi (7, 12). La fièvre entérique se caractérise par une fièvre (qui augmente dans les 72 heures suivant le début de la maladie) et des céphalées, une brachycardie, une éruption cutanée de couleur rose pâle sur l’abdomen et la poitrine, une anorexie, des douleurs abdominales, des myalgies, un malaise, une diarrhée (plus fréquente chez les enfants) ou une constipation (plus fréquente chez les adultes), une hépatosplénomégalie, un iléus segmentaire, un méningisme et des manifestations neuropsychiatriques (4, 7). Les symptômes moins fréquents sont le mal de gorge, la toux et la diarrhée sanglante (4). Les complications comprennent la myocardite, l’encéphalopathie, la coagulation intravasculaire, les infections de l’arbre biliaire et du tractus intestinal, l’infection des voies urinaires et les lésions métastatiques dans les os, les articulations, le foie et les méninges (7, 8). La complication la plus grave (qui survient chez environ 3 % des patients) est l’hémorragie due aux perforations de l’iléon terminal ou des parois du côlon proximal (4, 7). En l’absence de traitement, la fièvre peut durer des semaines ; toutefois, avec un traitement antimicrobien approprié, les patients se rétablissent généralement en 10 à 14 jours (7). La maladie est plus bénigne chez les enfants et, si elle est traitée, le taux de mortalité est inférieur à 1 % ; les cas non traités peuvent avoir un taux de mortalité supérieur à 10 % (2, 4).

Epidémiologie : Les infections à Salmonella enterica se produisent dans le monde entier ; cependant, certaines maladies sont plus répandues dans différentes régions. La salmonellose non typhoïde est plus fréquente dans les pays industrialisés alors que la fièvre entérique est surtout présente dans les pays en développement (avec le plus grand nombre de cas en Asie) (4, 12). On dénombre environ 1,3 milliard de cas de salmonellose non typhoïde dans le monde chaque année et l’OMS estime à 17 millions le nombre de cas et à plus de 500 000 le nombre de décès causés chaque année par la fièvre typhoïde (4, 10). On observe un pic de la maladie en été et en automne, et elle est plus fréquente chez les enfants (2, 7, 9). Dans le monde en développement, la salmonellose contribue à la morbidité et à la mortalité liées à la diarrhée infantile, la bactérie étant responsable d’environ 20 % des cas (4, 13). Des épidémies de salmonellose ont été signalées dans des institutions telles que les hôpitaux et les maisons de retraite (7).

GAMME D’HÔTES : Pour les sérotypes provoquant des salmonelloses non typhoïdiques, les hôtes primaires sont les animaux domestiques et sauvages tels que les bovins, les porcs, les volailles, les oiseaux sauvages et les animaux de compagnie (en particulier les reptiles) ainsi que les mouches (8, 14, 15). L’homme est généralement l’hôte final (8). Pour Salmonella Typhi, l’homme est le seul hôte connu (7).

DOSE INFECTIEUSE : La dose infectieuse varie en fonction du sérotype. Pour la salmonellose non typhoïde, la dose infectieuse est d’environ 103 bacilles (4, 7). Pour la fièvre entérique, la dose infectieuse est d’environ 105 bacilles par ingestion (4, 6, 7). Les patients souffrant d’achlorhydrie, de dépression de l’immunité à médiation cellulaire ou les personnes âgées peuvent être infectés à une dose infectieuse plus faible (4, 7). La dose infectieuse peut également dépendre du niveau d’acidité de l’estomac du patient (4).

MODE DE TRANSMISSION : L’infection humaine se produit généralement lors de la consommation d’aliments et d’eau contaminés, du contact avec des matières fécales infectées, ainsi que du contact avec des animaux infectés, des aliments pour animaux ou des humains (2, 4, 7, 8, 16). Les aliments qui présentent un risque plus élevé sont la viande, la volaille, les produits laitiers et les ovoproduits (7-9). Dans les hôpitaux, la bactérie a été transmise par le personnel des services pédiatriques, soit sur leurs mains, soit sur des scopes insuffisamment désinfectés (5, 17). Les mouches peuvent infecter les aliments qui peuvent également constituer un risque de transmission à l’homme (18, 19).

PÉRIODE D’INCOUVERTURE : Pour la salmonellose non typhoïdique, la période d’incubation est variable, dépend de la taille de l’inoculum et se situe généralement entre 5 et 72 heures (8). Pour la fièvre typhoïde, la période d’incubation peut être comprise entre 3 et 60 jours, bien que la plupart des infections surviennent 7 à 14 jours après la contamination (4). La période d’incubation de la fièvre typhoïde est très variable et dépend de la taille de l’inoculum, de la sensibilité de l’hôte et de la souche bactérienne (2, 4).

COMMUNICABILITÉ : L’homme peut propager la maladie tant qu’il excrète la bactérie dans ses selles (20). Certains porteurs excrètent la bactérie pendant des années et 5 % des patients se remettant d’une salmonellose non typhoïde peuvent excréter la bactérie pendant 20 semaines (7). Les animaux peuvent avoir un état latent ou porteur où ils excrètent l’organisme de façon brève, intermittente ou persistante (4).

SECTION III – DISSEMINATION

RESERVOIR : Pour la salmonellose non typhoïde, les hôtes réservoirs sont les animaux domestiques et sauvages tels que les bovins, les porcs, les volailles, les oiseaux sauvages, les mouches et les animaux de compagnie (en particulier les reptiles), ainsi que d’autres humains (avec l’état de porteur chronique) (7, 8, 14, 18). Pour le sérotype Typhi, les humains ayant l’état de porteur chronique sont le seul réservoir de la maladie (7, 14).

ZOONOSE : Oui. La transmission entre les animaux et les humains se produit lorsque les humains sont en contact avec des animaux infectés et leurs excréments (2, 8).

VECTEURS : Les mouches sont un vecteur indirect possible car elles peuvent transmettre la bactérie aux aliments (19).

SECTION IV – STABILITÉ ET VIABILITÉ

SUSCEPTIBILITÉ AUX MÉDICAMENTS : Susceptible au chloramphénicol, à la ciproflaxine, à l’amoxicilline, au cotrimoxazole, au triméthprim-sulfonamide, aux céphalosporines et à la norfloxacine (4, 8). Une certaine résistance au chloramphénicol a été signalée et, en 1989, 32% des souches étaient multirésistantes (2, 4, 17).

SUSCEPTIBILITÉ AUX DÉSINFECTANTS : Les bactéries à Gram négatif sont sensibles au phénol à 2-5%, à l’hypochlorite de sodium à 1%, au formaldéhyde à 4%, au glutaraldéhyde à 2%, à l’éthanol à 70%, au propanol à 70%, à l’acide peracétique à 2%, au peroxyde d’hydrogène à 3-6%, aux composés d’ammonium quaternaire et aux iodophores ; cependant, Salmonella spp. est résistante aux nitrites (6, 17).

INACTIVATION PHYSIQUE : Sensible à la chaleur humide (121 ºC pendant au moins 15 minutes) et à la chaleur sèche (170 ºC pendant au moins 1 heure) (17). Les Salmonella spp peuvent également être désinfectées à l’ozone (17).

SURVIE HORS DE L’HÔTE : Le sérotype Choleraesuis peut survivre dans les matières fécales humides des porcs pendant au moins 3 mois et dans les matières fécales sèches des porcs pendant au moins 13 mois (21). Le sérotype Dublin peut survivre dans des matières fécales étalées sur du béton, du caoutchouc et du polyester pendant presque six ans (17). Le sérotype Typhimurium peut survivre dans le lisier de bovins pendant 19 à 60 jours, dans le fumier de bovins pendant 48 jours, dans le sol pendant 231 jours et dans l’eau pendant un maximum de 152 jours (22, 23). Il a été démontré que les mouches excrètent certains sérotypes pendant 8 jours et que les punaises de lit peuvent excréter les bacilles jusqu’à 21 jours (15, 24). Il a été démontré que certains sérotypes pouvaient survivre jusqu’à 80 minutes sur le bout des doigts, selon la taille de l’inoculum (25). On a constaté que des sérotypes de Salmonella pouvaient vivre jusqu’à 63 jours sur de la laitue, 231 jours sur du persil, 32 semaines dans des pacanes, 10 mois sur du cheddar réfrigéré, 9 mois dans du beurre, jusqu’à 63 jours dans du yogourt congelé et jusqu’à 20 semaines sur du bœuf et du poulet hachés congelés (26-28).

SECTION V – PREMIERS SOINS / MÉDICAUX

SURVEILLANCE : Surveillez l’apparition de symptômes. Confirmer le diagnostic par isolement à partir de selles ou de sang et par sérotypage pour identifier le sérotype (7, 8).

Note : Toutes les méthodes de diagnostic ne sont pas nécessairement disponibles dans tous les pays.

PREMIERS SOINS/TRAITEMENT : Le traitement dépend des symptômes cliniques présentés par le patient.

Gastro-entérite : Le remplacement des liquides et des électrolytes ainsi que le contrôle des nausées et des vomissements sont les traitements habituels de ces symptômes (7, 8). Le traitement antibiotique n’est généralement pas utilisé ; cependant, il peut être nécessaire pour les nouveau-nés, les enfants, les personnes âgées et les immunodéprimés, auquel cas la ciproflaxine, le cotrimoxazole, l’ampicilline et les céphalosporines peuvent être utilisés (4, 7, 8).

Bactériémie : Un traitement antibiotique est utilisé pour traiter la bactériémie (par exemple, ciproflaxine, cotrimoxazole, ampicilline ou céphalosporines), en particulier pour les nouveau-nés, les enfants, les personnes âgées et les personnes immunodéprimées (7, 8).

Fièvre entérique : Le chloramphénicol est l’antibiotique le plus utilisé pour la fièvre entérique bien que l’ampicilline, le triméthoprime-sulfonamide, les céphalosporines, la ciproflaxine et la norfloxacine soient également utilisés pour traiter la maladie (4, 7).

État de porteur asymptomatique : Les porteurs peuvent être traités par la ciproflaxine afin de réduire la propagation de l’agent infectieux (8).

IMMUNISATION : Il n’existe actuellement aucun vaccin pour prévenir la salmonellose non typhoïde (14). Trois vaccins (2 parentéraux et 1 oral) sont autorisés aux Etats-Unis et doivent être envisagés pour les personnes travaillant avec le sérotype Typhi dans un laboratoire et pour les voyageurs qui vont passer des périodes prolongées dans des zones endémiques (4, 7, 14). Les vaccins disponibles offrent une protection modérée contre la fièvre typhoïde, mais ils ne protègent pas contre le sérotype Paratyphi de la bactérie (12). Il a été démontré qu’un vaccin oral vivant protège 70% des enfants inoculés dans les zones endémiques (7). La vaccination n’est pas recommandée pour les femmes enceintes et les patients atteints du VIH-sida (29).

PROPHYLAXIE : Les antibiotiques peuvent être utilisés en prophylaxie chez les personnes à risque (par exemple les nouveau-nés et les personnes immunodéprimées) (7). L’approvisionnement en eau propre, l’assainissement et le traitement des porteurs sont les meilleures mesures prophylactiques pour prévenir la propagation de la fièvre entérique dans les zones endémiques (7).

SECTION VI – DANGERS DE LABORATOIRE

INFECTIONS ACQUISES EN LABORATOIRE : Jusqu’en 1974, 258 cas et 20 décès dus à la fièvre typhoïde acquise en laboratoire ont été signalés (6). 48 cas de salmonellose ont été signalés jusqu’en 1976 (2). 64 cas et 2 décès dus à des infections à Salmonella spp. ont été signalés entre 1979 et 2004, la plupart étant associés à S. Typhi (30).

SOURCES/SPECIMENS : Toutes les sous-espèces de Salmonella enterica (à l’exception du sérotype Typhi) se retrouvent dans le sang, l’urine, les fèces, les aliments pour humains et animaux et les matériaux environnementaux (14). Le sérotype Typhi se retrouve dans le sang, l’urine, les fèces et la bile (14).

DANGERS PRIMAIRES : Les dangers primaires lors du travail avec Salmonella enterica sont l’inoculation parentérale accidentelle et l’ingestion (14). Le risque associé à l’exposition aux aérosols n’est pas encore connu (14).

Dangers particuliers : Les animaux infectés constituent un risque (pour tous les sérotypes sauf Typhi et Paratyphi) (14).

SECTION VII – CONTRÔLES DE L’EXPOSITION / PROTECTION INDIVIDUELLE

CLASSIFICATION DU GROUPE DE RISQUE : Groupe de risque 2 (31). Le groupe de risque associé à Salmonella enterica ssp. reflète l’espèce dans son ensemble, mais ne reflète pas nécessairement la classification du groupe de risque de chaque sous-espèce.

EXIGENCES DE CONFINEMENT : Des pratiques, des équipements de sécurité et des installations de niveau de confinement 2 sont recommandés pour les travaux impliquant des matières infectieuses ou potentiellement infectieuses, des animaux ou des cultures. Les pratiques et procédures de niveau de confinement 3 sont recommandées pour les activités avec le sérotype typhi qui pourraient générer des aérosols ou de grandes quantités d’organismes. Ces exigences de confinement s’appliquent à l’espèce dans son ensemble, et peuvent ne pas s’appliquer à chaque sous-espèce de l’espèce.

Vêtements de protection : blouse de laboratoire. Gants lorsque le contact cutané direct avec des matériaux ou des animaux infectés est inévitable. Une protection oculaire doit être utilisée lorsqu’il existe un risque connu ou potentiel d’exposition aux éclaboussures (32).

AUTRES PRÉCAUTIONS : Toutes les procédures susceptibles de produire des aérosols, d’impliquer de fortes concentrations ou de grands volumes doivent être réalisées dans une enceinte de sécurité biologique (BSC). L’utilisation d’aiguilles, de seringues et d’autres objets tranchants doit être strictement limitée. L’utilisation d’aiguilles, de seringues et d’autres objets tranchants doit être strictement limitée. Des précautions supplémentaires doivent être envisagées lors de travaux impliquant des animaux ou des activités à grande échelle (32).

SECTION VIII – MANIPULATION ET STOCKAGE

Déversement : Laisser les aérosols se déposer, puis, en portant des vêtements de protection, couvrir délicatement le déversement avec du papier absorbant et appliquer le désinfectant approprié, en commençant par le périmètre et en allant vers le centre. Laisser un temps de contact suffisant avant de commencer le nettoyage (32).

ÉLIMINATION : Tous les déchets doivent être décontaminés avant d’être éliminés soit par stérilisation à la vapeur, incinération ou désinfection chimique (32).

STOCKAGE : L’agent infectieux doit être entreposé dans un contenant scellé et identifié (32).

SECTION IX – INFORMATIONS RÉGLEMENTAIRES ET AUTRES

INFORMATIONS RÉGLEMENTAIRES : L’importation, le transport et l’utilisation d’agents pathogènes au Canada sont réglementés par de nombreux organismes de réglementation, notamment l’Agence de santé publique du Canada, Santé Canada, l’Agence canadienne d’inspection des aliments, Environnement Canada et Transports Canada. Il incombe aux utilisateurs de s’assurer qu’ils se conforment à l’ensemble des lois, règlements, directives et normes pertinents.

MISE À JOUR : Août 2010

Préparé par : Direction de la réglementation des agents pathogènes, Agence de la santé publique du Canada.

Bien que les informations, les opinions et les recommandations contenues dans cette fiche de données de sécurité sur les agents pathogènes soient compilées à partir de sources jugées fiables, nous n’acceptons aucune responsabilité quant à l’exactitude, la suffisance ou la fiabilité, ni pour toute perte ou tout préjudice résultant de l’utilisation de ces informations. Les dangers nouvellement découverts sont fréquents et ces informations peuvent ne pas être complètement à jour.