Le test de diagnostic Angelman, Prader-Willi est rapide, précis et moins coûteux
On janvier 5, 2022 by adminDes chercheurs ont mis au point un nouveau test de diagnostic moléculaire rapide et précis pour les patients atteints soit du syndrome Angelman, soit du syndrome Prader-Willi.
Leur étude, « A rapid and accurate methylation-sensitive high-resolution melting analysis assay for the diagnosis of Prader Willi and Angelman patients, » a été publiée dans Molecular Genetics & Genomic Medicine.
Les syndromes de Prader-Willi (PWS) et d’Angelman (AS) sont deux troubles génétiques rares causés par des défauts d’empreinte dans la même région du chromosome 15. Alors que le SPW est associé à une perte de fonction des gènes paternels, le syndrome d’Angelman est causé par une perte de fonction des gènes maternels. L’empreinte génomique est le processus par lequel une copie d’un gène, soit la copie maternelle ou paternelle, est réduite au silence par une modification chimique de l’ADN appelée méthylation.
« Le diagnostic en laboratoire du SPW et du SA est un défi et exige plusieurs méthodes moléculaires et cytogénétiques pour élucider le mécanisme génétique qui conduit au développement du syndrome », ont écrit les chercheurs.
L’analyse des schémas de méthylation de l’ADN dans une région spécifique du chromosome 15 – connue sous le nom de locus SNURF-SNRPN par réaction en chaîne par polymérase spécifique à la méthylation (MS-PCR, une technique qui détecte les changements de méthylation de l’ADN dans des régions spécifiques d’une séquence d’ADN) – permet aux chercheurs de diagnostiquer et de distinguer les patients atteints du SPW de ceux atteints du SA.
« Même si le séquençage de l’ADN est considéré comme la « norme d’or » pour le dépistage des mutations, cette méthodologie reste relativement coûteuse, laborieuse et longue », ont écrit les chercheurs.
Dans cette étude, les scientifiques ont développé une méthode basée sur la fusion à haute résolution (HRM, une technique qui permet aux chercheurs de distinguer les séquences d’ADN normales et mutées en fonction de leur profil de fusion). Il s’agit d’une alternative simple, rapide, sensible, spécifique et peu coûteuse au séquençage de l’ADN pour diagnostiquer et distinguer les patients atteints du SPW et du SA.
Pour tester et valider la nouvelle méthode MS-HRM, les chercheurs ont d’abord isolé l’ADN d’échantillons de sang de 43 patients soupçonnés d’être atteints du SPW ou du SA. Ils ont ensuite réalisé et comparé les résultats de la MS-PCR standard à la nouvelle méthode MS-HRM.
Les résultats des tests ont montré que la MS-HRM et la MS-PCR étaient en accord dans tous les cas, identifiant 19 (44%) patients atteints du SPW, trois (7%) atteints de SA et 21 (49%) sans aucune altération.
Une hybridation in situ en fluorescence (FISH, une technique qui permet aux chercheurs de visualiser des régions spécifiques des chromosomes marqués avec une sonde fluorescente) réalisée sur 19 (44%) patients a permis de détecter quatre cas de SPW causés par une délétion (où une partie de la séquence d’ADN d’un gène est perdue) dans le chromosome 15.
La MS-HRM « ne nécessite pas de techniques supplémentaires telles que l’électrophorèse en gel d’agarose , réduisant le temps nécessaire pour obtenir un résultat précis et réduisant les risques de contamination croisée entre les échantillons », ont écrit les chercheurs.
« La sensibilité de la MS-HRM permet la détection d’une infime fraction d’échantillon est importante dans l’analyse des échantillons, qui sont difficiles à obtenir en particulier chez les nouveau-nés hypotoniques. En outre, la reproductibilité élevée de la MRH rend cette méthode adaptée à la fois à la recherche et aux applications diagnostiques dans l’étude des syndromes du SPW et du SA », ont-ils ajouté.
« Un diagnostic rapide et précis du SPW ou du SA permet une intervention médicamenteuse efficace, évitant plusieurs caractéristiques de ces troubles, offrant une meilleure qualité de vie », ont-ils conclu.
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