Ruoansulatuskanavan mikrofloora: katsaus

Ihmisen ruoansulatuskanavan (GI) limakalvopinta-ala on noin 200-300 m2, ja sitä kolonisoi 1013-14 bakteeria 400 eri lajista ja alalajista. Savage on määritellyt ja luokitellut ruoansulatuskanavan mikroflooran kahteen tyyppiin, autoktoniseen kasvistoon (kotoperäinen kasvisto) ja alloktoniseen kasvistoon (ohimenevä kasvisto). Autoktoniset mikro-organismit kolonisoivat tietyt elinympäristöt eli ruoansulatuskanavan fyysiset tilat, kun taas alloktoniset mikro-organismit voivat kolonisoitua tiettyihin elinympäristöihin vain poikkeavissa olosuhteissa. Useimmat patogeenit ovat alloktonisia mikro-organismeja; jotkin patogeenit voivat kuitenkin olla ekosysteemin autoktonisia ja elää normaalisti sopusoinnussa isännän kanssa, paitsi silloin kun järjestelmä häiriintyy. Bakteerien esiintyminen ruoansulatuskanavan eri osissa näyttää riippuvan useista tekijöistä, kuten pH:sta, peristaltiikasta, redox-potentiaalista, bakteerien adheesiosta, bakteeriyhteistyöstä, limakalvojen erityksestä, ravintoaineiden saatavuudesta, ruokavaliosta ja bakteerien antagonismista. Mahalaukun alhaisen pH:n ja mahalaukun ja ohutsuolen suhteellisen nopean peristaltiikan vuoksi mahalaukussa ja ohutsuolen kahdessa ylemmässä kolmanneksessa (pohjukaissuolessa ja pohjukaissuolessa) on vain vähän mikro-organismeja, joiden määrä vaihtelee välillä 103-104 bakteeria/ml mahalaukun tai suolen sisältöä, pääasiassa happoa sietäviä laktobasilleja ja streptokokkeja. Distaalisessa ohutsuolessa (ileum) mikrofloora alkaa muistuttaa paksusuolen mikroflooraa, jossa on noin 107-108 bakteeria/ml suolen sisältöä. Koska peristaltiikka, happamuus ja hapettumis-pelkistymispotentiaali ovat vähentyneet, ileumissa on monipuolisempi mikrofloora ja suurempi bakteeripopulaatio. Todennäköisesti hitaan suoliston liikkuvuuden ja hyvin alhaisen hapettumis-pelkistymispotentiaalin vuoksi paksusuoli on ensisijainen mikrobien kolonisaatiopaikka ihmisillä. Paksusuolessa elää valtava määrä ja lajeja bakteereja. Kuitenkin 99,9 prosenttia paksusuolen mikrofloorasta on pakollisia anaerobeja.