The Human Protein Atlas
On Oktober 19, 2021 by adminDie Suchfunktion kann für eine Freitextsuche (geben Sie irgendetwas in das Suchfeld ein) oder für komplexere Abfragen unter Verwendung von „Feldern“ verwendet werden (siehe Beispiele).
Die Freitextsuche sucht nach vollständigen und teilweisen Übereinstimmungen mit Gennamen, Gensynonymen, Genbeschreibungen, externen (UniProt, Ensembl, NCBI Entrez Gene) Gen- und Proteinbezeichnern, Proteinklassen, Gene Ontology-Bezeichnern und -Beschreibungen, Antikörperbezeichnern und Bildannotationen. Das Wort der Freitextabfrage muss mindestens drei Zeichen lang sein.
Spezifische Felder können mit der „Fields“-Funktion durchsucht werden. Verfügbare Felder sind: Genname (HGNC-Name oder Synonyme), Proteinklasse, Chromosom, Externer Identifikator (Ensembl-Gen-, Transkript- oder Protein-Identifikator, UniProt-Zugangsnummer, NCBI-Entrez-Gen-Identifikator), Subzellulärer Ort basierend auf Immunfluoreszenzfärbung in drei verschiedenen Zelllinien, Organ-, Gewebe-, Krebs- und Zelllinienexpression, Ergebnisse der Antikörpervalidierung in vier verschiedenen Assays (IH=Immunhistochemie, IF=Immunfluoreszenz, WB=Western Blot, PA=Protein Array), Evidence Scores und eine Filterung nach Genen mit nur Antikörpern und Genen mit wissensbasierter annotierter Proteinexpression (IH, IF).
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