The Human Protein Atlas
On oktober 19, 2021 by adminSøgefunktionen kan bruges til fritekstsøgning (skriv hvad som helst i søgefeltet), eller til mere komplekse forespørgsler ved hjælp af “Fields” (se eksempler).
Fri tekstsøgningen vil søge efter fuldstændige og delvise match til gennavne, gensynonymer, genbeskrivelser, eksterne (UniProt, Ensembl, NCBI Entrez Gene) gen- og proteinidentifikatorer, proteinklasser, Gene Ontology-identifikatorer og -beskrivelser, antistofidentifikatorer og billedannotationer. Det frie tekstforespørgselsord skal være mindst tre tegn langt.
Specifikke felter kan søges ved hjælp af “Fields”-funktionen. Følgende felter er tilgængelige: Gennavn (HGNC-navn eller synonymer), Proteinklasse, Kromosom, Ekstern identifikator (Ensembl-gen-, transkript- eller proteinidentifikator, UniProt-tilslutningsnummer, NCBI Entrez-genidentifikator), Subcellulær placering baseret på immunofluorescerende farvning i tre forskellige cellelinjer, Organ-, vævs-, kræft- og cellelinjeekspression, valideringsresultater for antistoffer i fire forskellige assays (IH=immunohistokemi, IF=immunofluorescens, WB=Western blot, PA=Protein array), evidensscorer og en filtrering på gener kun med antistoffer og gener med vidensbaseret annoteret proteinekspression (IH, IF).
Skriv et svar