Diagnostisk test til Angelman- og Prader-Willi-syndromet er hurtig, præcis og mindre dyr
On januar 5, 2022 by adminForskere har udviklet en ny hurtig og præcis molekylær diagnostisk test til patienter med enten Angelman- eller Prader-Willi-syndromet.
Deres undersøgelse, “A rapid and accurate methylation-sensitive high-resolution melting analysis assay for the diagnosis of Prader Willi and Angelman patients,” blev offentliggjort i Molecular Genetics & Genomic Medicine.
Prader-Willi (PWS) og Angelman (AS) syndromer er to sjældne genetiske lidelser forårsaget af imprægneringsfejl i den samme region af kromosom 15. Mens PWS er forbundet med tab af funktion af faderlige gener, skyldes Angelman tab af funktion af moderlige gener. Genomisk prægning er den proces, hvorved den ene kopi af et gen, enten den maternelle eller den faderlige kopi, er tavs ved en kemisk DNA-modifikation kaldet methylering.
“Laboratoriediagnosen af PWS og AS er en udfordring og kræver flere molekylære og cytogenetiske metoder for at klarlægge den genetiske mekanisme, der fører til udviklingen af syndromet”, skrev forskerne.
Analyser af DNA-methyleringsmønstre i et specifikt område af kromosom 15 – kendt som SNURF-SNRPN-lokus ved methyleringsspecifik polymerasekædereaktion (MS-PCR, en teknik, der påviser ændringer i DNA-methylering i specifikke områder af en DNA-sekvens) – giver forskerne mulighed for at diagnosticere og skelne patienter med PWS fra dem med AS.
“Selvom DNA-sekventering betragtes som “guldstandarden” for mutationsscreening, er denne metode fortsat relativt dyr, besværlig og tidskrævende,” skrev forskerne.
I denne undersøgelse udviklede forskerne en metode baseret på højopløsende smeltning (HRM, en teknik, der gør det muligt for forskere at skelne mellem normale og muterede DNA-sekvenser baseret på deres smeltningsprofil). Det er et simpelt, hurtigt, følsomt, specifikt og billigt alternativ til DNA-sekventering til at diagnosticere og skelne mellem PWS- og AS-patienter.
For at teste og validere den nye MS-HRM-metode isolerede forskerne først DNA fra blodprøver fra 43 patienter, der mistænkes for at have enten PWS eller AS. Derefter udførte de og sammenlignede resultaterne fra standard MS-PCR med den nye MS-HRM-metode.
Testresultaterne viste, at MS-HRM og MS-PCR var i overensstemmelse i alle tilfælde, idet de identificerede 19 (44 %) patienter med PWS, tre (7 %) med AS og 21 (49 %) uden forandringer.
Suafhængig fluorescens in situ hybridisering (FISH, en teknik, der gør det muligt for forskere at visualisere specifikke regioner af kromosomer mærket med en fluorescerende sonde) udført på 19 (44%) patienter påviste fire tilfælde af PWS forårsaget af en deletion (hvor en del af DNA-sekvensen af et gen går tabt) i kromosom 15.
MS-HRM “kræver ikke yderligere teknikker som agarosegelelektroforese , hvilket reducerer den tid, det tager at opnå et nøjagtigt resultat, og reducerer risikoen for krydskontaminering mellem prøverne”, skrev forskerne.
“MS-HRM’s følsomhed gør det muligt at påvise en lille brøkdel af prøven er vigtig i analysen af prøver, som er vanskelige at få, især fra nyfødte hypotone spædbørn. Desuden gør høj reproducerbarhed af HRM denne metode egnet til både forskning og diagnostiske anvendelser i undersøgelsen af PWS- og AS-syndromer,” tilføjede de.
“En hurtig og præcis diagnose af PWS eller AS giver mulighed for en effektiv medicinsk intervention, der undgår flere karakteristika ved disse lidelser, hvilket giver en bedre livskvalitet,” konkluderede de.
- Author Details
Skriv et svar