The Human Protein Atlas

Vyhledávací funkci lze použít pro volné textové vyhledávání (zadejte cokoli do vyhledávacího pole) nebo pro složitější dotazy pomocí „Fields“ (viz příklady).
Volné textové vyhledávání vyhledá úplné a částečné shody s názvy genů, synonymy genů, popisy genů, externími (UniProt, Ensembl, NCBI Entrez Gene) identifikátory genů a proteinů, třídami proteinů, identifikátory a popisy genové ontologie, identifikátory protilátek a obrazovými anotacemi. Volné textové slovo dotazu musí být dlouhé alespoň tři znaky.
Konkrétní pole lze vyhledávat pomocí funkce „Fields“. K dispozici jsou tato pole: Název genu (název HGNC nebo synonyma), třída proteinu, chromozom, externí identifikátor (identifikátor genu, transkriptu nebo proteinu Ensembl, přístupové číslo UniProt, identifikátor genu NCBI Entrez), subcelulární umístění na základě imunofluorescenčního barvení ve třech různých buněčných liniích, orgán-, tkáň-, exprese v nádorových a buněčných liniích, výsledky validace protilátek ve čtyřech různých testech (IH=imunohistochemie, IF=imunofluorescence, WB=Western blot, PA=Protein array), skóre důkazů a filtrace na Geny pouze s protilátkami a Geny s expresí proteinů anotovaných na základě znalostí (IH, IF).